Dispone de cinco líneas estratégicas y quince objetivos plurianuales. De forma propia y en colaboración con otros actores, hay previstos programas sobre procesos de paz, ciclo del armamentismo, desarmamiento, governanza descentralizada y prevención de la violencia, seguridad humana, derecho internacional humanitario, transformación de conflictos, políticas del pasado y justicia transicional, derecho humanitario, investigación para la paz. También habrá observatorios permanentes especializados.
Existirán becas (predoctorales y postdoctorales), programas de corta duración, estancias de investigaciones y prácticas, así como programas de ayudas concretas.