Les EMD tenen un sistema electoral dual, ja que els/les electors/es emeten un vot directe per a escollir la presidència de l’EMD i, en paral·lel, un vot indirecte per a designar els/les vocals que han d’integrar la junta de veïns/es. Aquests es regeixen per normes electorals diferents.
Pel que fa l’elecció del president o presidenta de l’entitat, les característiques bàsiques del sistema electoral d’acord amb la legislació vigent són les següents:
- El president o presidenta de l’EMD és escollit/da directament pels/les veïns/es de l’entitat pel sistema majoritari.
- Les candidatures són unipersonals, però han d’incloure el nom d’una persona suplent, que suplirà el càrrec de president o presidenta en cas de mort, incapacitat o renúncia.
Pel que fa els/les vocals, aquests/es:
- Són designats/ades entre els/les veïns/es de l’entitat pels partits, coalicions, federacions o agrupacions d’electors/es, de conformitat amb els resultats de les eleccions municipals en la secció o les seccions electorals constitutives de l'entitat.
- El repartiment de vocalies es fa segons la fórmula d’Hondt.
El mandat del president o presidenta de l’entitat i dels/les vocals de la junta de veïns/es dura quatre anys i coincideix temporalment amb el dels regidors o regidores dels ajuntaments.
La junta de veïns/es es constitueix el dia que determini la Junta Electoral de Zona corresponent, un cop efectuades les operacions electorals necessàries per determinar el nombre de vocals que corresponen a cada partit, coalició, federació o agrupació d’electors/es.